神经外科由院长张玉琪牵头，汇集一批高学历、临床及带教经验丰富的医师，是清华大学医学院博士后工作站，也是清华大学医学院教学单位及临床实践基地，并担任课程教学任务。

内分泌科秉承“真清华”、“真三级”、“真结合”的理念，引进国家卫健委临床重点专科（中医内分泌）和国家中医药管理局“十二五”中医糖尿病重点专科人才和建设成果，突出中西医结合优势和特色，针对糖尿病及其并发症、甲状腺疾病、免疫系统等疾病，以病人为中心，辨证运用中医药对人体多层次、多环节、多靶点的整合调整作用，从内分泌、代谢、免疫角度防治各种疑难杂症，同时注重发挥中医“治未病”优势，突出慢性病的全周期（院前、院中、院后）的智能化健康管理，重视中医内治法（口服中药汤剂）与外治法（耳穴、针刺、艾灸、中药熏洗、穴位贴敷）相结合，为患者提供中、西医结合的综合医疗服务。

精神卫生科以基于脑科学研究探索精神疾病诊断及治疗新方案、郁症精准诊断联盟健康社区平台建设、抑郁症的中西医结合治疗方案探索、人工智能领域在精神科的应用和儿童青少年家庭亲子平衡系统体系建设等为重点发展方向，不断发展和完善神经精神器官系统学科建设。

清华大学玉泉医院妇产科具有扎实发展的传统和底蕴，推行女性全生命周期以及孕前、孕期、产时、产后一体化医疗与保健相结合的服务模式。发展中医在妇产科领域的应用，将中医元素融入围产保健，采取孕产期合并症及并发症的中西医结合诊疗方案。